目前二代高通量测序已经成为研究肠道菌群结构常用的一种方法,该方法仅仅可以得到样本中微生物的种类和相对丰度,但是无法拿到具体菌株。微基生物专注微生态研究和应用,不仅具有二代高通量测序平台,而且还建立了肠道菌群需氧/厌氧分离培养平台,为客户提供高效的需氧/厌氧菌的靶向分离培养服务,帮助客户获得特定菌株。
本公司建有需氧和厌氧平台,可以帮助客户进行需氧/厌氧菌株的活化、扩繁和培育特定菌株和分离特定的菌株;菌株分离就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选,进而得到所需微生物的过程。
菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16s rDNA片段,上机测序之后,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在99%以上就可以认为是同一个种细菌(当然也有例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。 常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。
人工多菌共培养系统,将复杂的生物合成途径和功能分布到不同菌种中,然后将这些具有不同功能的菌株共培养后得到目标产物,有效进行异源生物合成,有望成为提高产物产量的新发酵方法。