产品概述
病毒宏基因组测序又称宏病毒组（Virome），是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。 宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象，能够快速准确的鉴定环境中所有的病毒组成， 是一种发现新病毒、 病毒感染预警和控制的有力手段， 在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。
技术路线
缮菌CRO
本公司优势
本公司拥有独有的富集技术与专利技术，利用超速离心进行高效的病毒核酸富集，同时，本公司是业内最可靠的病毒分析公司，有丰富的项目经验，拥有专家顾问团队制定严谨的分析思路，配置最合适的分析工具，力求还原真实病毒组成与丰度，对数据进行全面挖掘；此外，我们的顶尖病毒生信研发和分析团队，针对客户的个性化需求出谋划策，力求实现。
应用方向
农业领域：土壤、植物相关研究，目前相对而言这个方向的成果比较少，但应用价值很高，若能有效转化，可带来很大的经济价值。
畜牧领域：从动物养殖中比较常见的疾病入手，如腹泻、猪瘟、口蹄疫等，这些疾病均可以用病毒组测序技术来进行相关研究，为疫情的防控以及疾病的治疗奠定基础。
环境领域：从环境角度入手可以细分为许多不同的研究方向，比如公共交通系统、医院环境、海洋、淡水水体、空气、冰川等等，这些领域都有少量病毒组研究的相关报道。此外，病毒组与考古相关的研究在文物保护与保存方面有着重要的意义。
结果展示
缮菌CRO
样本要求
水体样本：清澈水体或海水：20L以上超滤浓缩或者FeCL3沉淀之后送样；其他类型水体视水质情况而定；
环境样本：土壤、淤泥、沉积物≥3g；粪便或肠道内容物≥3g；组织样本≥2g；血液样本≥10mL（建议送血清）；
运输要求：样品全程使用干冰运输，避免反复冻融。
应用案例
Fujimoto K , Kimura Y , Allegretti J R , et al. Functional Restoration of Bacteriomes and Viromes by Fecal Microbiota Transplantation[J]. Gastroenterology, 2021.
期刊：GASTROENTEROLOGY
IF：22.682
发表时间：2021
主要内容
来自大阪城市大学和东京大学医学科学研究所的研究人员，对从波士顿布里格姆和妇女医院的9名成功进行FMT的rCDI患者接受治疗前2周和治疗后8周（接受不同抗生素治疗，临床上诊断治愈）以及供体粪便样本的肠道细菌和病毒进行分析，发现了rCDI中参与发病的细菌和噬菌体，以及他们对肠道菌群功能恢复的重要途径。
图1. 治疗前后基于原噬菌体的细菌和噬菌体相关性
结论
通过对复发性艰难梭菌感染（CDI）患者FMT治疗前后及其供体肠道细菌组及真菌组分析发现，治疗后呈负相关的变形菌门（降低）和Microviridae（升高）；
次级胆汁酸生物合成富集和氟苯甲酸酯（fluorobenzoate）降解通路降低，从肠道细菌和病毒功能层面进一步阐释了FMT的安全有效性；
但FMT对肠道细菌功能恢复的稳定性如何，在治疗失败患者体内这些细菌如何变化以及是否受性别和地域等外部因素影响，有待进一步研究。
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