产品概述
真菌基因组de novo测序，是一种在无参考基因组的情况下，对微生物基因组序列进行从头组装，并结合数据库对基因组进行注释，以此为基础开展相关下游分析的产品。随着测序技术的发展、测序成本的降低，完成某真菌的全基因组序列图谱已成为必然趋势。一个物种基因组序列图谱的完成，将带动该物种一系列后续研究的开展。
技术路线
缮菌CRO
本公司优势
本公司采用2+3或2+3+HiC等测序策略对真菌基因组进行测序、组装以及功能注释，可根据不同需求选择真菌基因组调研图、真菌基因组精细图以及真菌基因组准完成图进行研究。同时，我们有丰富的项目经验，拥有专家顾问团队制定严谨的分析思路，配置最先进的分析工具，力求还原真实真菌组成与丰度，对数据进行全面挖掘；此外，我们的顶尖真菌生信研发和分析团队，针对客户的个性化需求出谋划策，力求实现。
应用方向
食品、能源等工业领域工程菌构建
真菌遗传进化分析
辅助多组学分析
结果展示
缮菌CRO
测序策略
送样要求
应用案例
Feng Y, Zhang J, Berdugo M, et al. Temperature thresholds drive the global distribution of soil fungal decomposers[J]. Global Change Biology, 2022.
期刊：GLOBAL CHANGE BIOLOGY
IF: 10.863
发表时间：2022
主要内容
通过研究土壤有机质转化过程中一类关键功能微生物群，腐生真菌的地理学分布格局，来推测全球增温对微生物多样性及其生态功能的影响和可能的反馈。
结论
研究发现，温度非线性控制了全球土壤腐生真菌地理学分布。其中，多个环境温度阈值影响全球土壤腐生真菌丰度变化，例如~9℃的年平均温度、~22℃的土壤温度以及~28℃的最热月份最高温度。一旦相应的环境温度跨过以上阈值，土壤腐生真菌丰度将急剧下降，而且此类现象在全球干旱地区更为敏感。
鉴于与土壤异养呼吸释放CO2量的正相关性，以及土壤碳含量也存在相近阈值，土壤腐生真菌丰度的陡降暗示了未来全球增温下，可能存在多个环境温度的突变点，会导致土壤微生物所驱动的元素地球化学循环过程出现多次断崖式崩塌，进而对陆地生态系统带来不可预测的负面影响。
提供更好的服务
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