微生物多样性测序,又称扩增子测序,是利用二/三代测序平台,以细菌/古菌16S rRNA基因可变区、真菌18S rRNA基因可变区或真菌ITS(Internal transcribed spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)为靶点,通过检测序列的变异和数量,反映菌群中各类微生物的种类和丰度,从而快速解码菌群物种分布特征,阐明样本间多样性和组成差异。
1)环境微生物生态学:微生物多样性测序可用于研究不同环境中微生物群落的组成、结构和变化,如土壤、水体、海洋、空气等。
2)医学微生物学:在人体、动物和植物的微生物群落中,微生物多样性测序可用于分析不同部位的微生物组成,以及与宿主健康和疾病之间的关系。它在疾病诊断、药物研发和预防措施中有着重要应用。
3)食品和饮食微生物学:微生物多样性测序可以揭示食品样本中的微生物群落,从而帮助监测食品质量、安全性和新型食品生产方法的发展。
4)生物工艺和发酵:在生物制药、酿造和发酵等领域,微生物多样性测序可以帮助优化微生物菌株的选择、改良和监控,以提高生产效率和产物质量。
5)生态学和保护:通过分析野生动植物、珍稀物种和生态系统中的微生物群落,可以了解微生物与宿主之间的相互作用,从而为物种保护和生态系统管理提供支持。
6)环境监测和生态修复:微生物多样性测序在环境污染监测、生态修复和污水处理等领域可以帮助识别有益微生物群落,以及监测生态系统恢复的进程。
7)系统发育和分类学:利用微生物多样性测序数据,可以进行微生物物种的分类、系统发育和进化关系分析,有助于解析不同物种之间的遗传关系。
8)生态毒理学:通过分析微生物群落对环境毒性的响应,可以评估环境污染对生态系统健康的影响,从而为环境保护提供信息。
1)价格优惠、交付周期短:提供综合比价通道,高效高质量的交付结果
2)疑难样本处理可处理:抽提效率高,最大化利用珍贵样本
3)严格的数据质控:严格的质量控制体系,保证准确性
4)测序平台:通量更高,速度更快,运行时间更短。
5)定制化分析方案:定制实验方法,个性化分析解决方案
利用聚合酶链式反应(PCR)技术,选择性地扩增特定的目标DNA片段,通常是细菌和古细菌的16S rRNA基因区域,或者真核生物的18S rRNA/ ITS区域。这些片段具有高度保守的序列区域,同时包含足够的变异区域,可以用于区分不同的微生物。