产品概述

宏转录组（Metatranscriptome）测序是指从整体水平上研究某一特定环境，特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段，它以RNA为研究对象，避开了微生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。获取微生物组总RNA并去除rRNA之后，反转录为cDNA，并构建合适长度的插入片段文库，对这些文库进行双端（Paired-end，PE）高通量测序，从而能精确定量整个菌群中具有活性的物种精细组成及其对应功能的表达水平，进而锁定菌群中的关键生物标记物、阐明其生物学意义。
转录组测序能够从整体水平研究基因表达量以及基因结构，揭示特定生物学过程中的分子机理，是基因功能及结构研究的基础。目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发等领域。转录组测序服务针对不同样本类型，采用全面解析mRNA信息的策略，同时获得样本转录本结构和转录丰度信息，还能探究相关基因结构变异（SNP、CNV、SV、Indel等）。此外我们拥有的大数据分析平台可以深入挖掘差异基因，分析致病机制，为您提供最全面、高效的生物信息分析以及整合利用公共数据库的全套解决方案。

我们的优势

1.价格优惠、交付周期短：提供综合比价通道，高效高质量的交付结果
2.疑难样本处理可处理：抽提效率高，最大化利用珍贵样本
3.严格的数据质控：严格的质量控制体系，保证准确性
4.测序平台：通量更高，速度更快，运行时间更短。
5.定制化分析方案 ：定制实验方法，个性化分析解决方案

技术原理

1）RNA提取：从环境样本中提取总的RNA。这些RNA包括mRNA（编码蛋白质的RNA）以及各种类型的非编码RNA，这些RNA反映了微生物在特定环境中的基因表达状态。
2）逆转录：提取到的RNA需要经过逆转录反应，将RNA转录成互补DNA，即cDNA。这一步骤利用逆转录酶使RNA作为模板合成互补的DNA链，生成与原始RNA相对应的cDNA。
3）文库构建： 将生成的cDNA进行处理，以创建测序所需的文库。这通常涉及将cDNA断裂成适当的片段，然后在片段的末端连接适配体序列。适配体序列包含识别标记，使得测序平台可以识别并读取每个片段的序列。
4）高通量测序：构建好的文库被送入高通量测序仪，该仪器能够同时读取成千上万个片段的DNA序列。这些片段对应于环境样本中不同微生物生物体产生的cDNA片段，这些片段的序列代表了微生物的转录活性。
5）数据分析：测序数据需要进行生物信息学分析。首先，将测序得到的片段与已知的基因组或转录组数据库进行比对，以确定每个片段的来源微生物。接着，通过计算每个片段的数量，可以估计不同微生物的基因表达水平。进一步的功能注释和通路分析可以揭示微生物在环境中的功能和代谢活性。

技术路线

缮菌CRO

应用方向

1.环境微生物生态学： 宏转录组测序可用于研究土壤、水体、空气等不同环境中微生物的转录活性。这有助于了解微生物在不同生态系统中的功能、相互作用以及对环境变化的响应。
2.生态互作研究： 通过分析微生物的转录活性，可以揭示微生物之间的相互作用、共生关系以及生态系统中的营养循环和能量流动。
3.疾病与宿主微生物组关系： 宏转录组测序可用于研究宿主与其共生微生物的相互作用。这有助于了解微生物在健康和疾病状态下的转录变化，以及它们对宿主免疫系统的影响。
4.生物工业： 在微生物发酵和产物合成过程中，宏转录组测序可用于监测微生物的基因表达情况，优化生产过程并提高产物产量。
5.污水处理和环境监测： 宏转录组测序可以帮助监测污水处理系统中微生物的功能和代谢活性，以提高处理效率。此外，它也可用于环境监测，帮助识别环境中的微生物种类和其代谢特征。
6.新药开发： 通过分析微生物在不同条件下的基因表达，可以寻找潜在的药物靶点或合成新的生物活性分子。
7.生态学研究： 宏转录组测序可用于研究特定生态系统中的微生物群体，以揭示其对环境变化的适应性和响应机制。
8.食品安全与质量控制： 宏转录组测序可以用于食品微生物的研究，有助于了解食品中微生物的代谢活性和潜在致病性。
9.生物多样性研究： 通过分析不同环境中的微生物转录活性，可以揭示微生物多样性的分布、变化以及生态系统中的生物地理学模式。