产品概述

二代真核转录组采用Illumina测序平台,对有参、无参真核生物特定细胞在某一功能状态下转录的所有mRNA进行测序。在定量层面,有参可以对基因进行定量分析,无参只能对Unigene(优化的转录本)进行定量分析,并进行下游的差异基因分析和功能注释等;在结构层面,有参可进行可变剪切、SNP分析、基因结构优化、新基因预测。目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。

应用方向

  • 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
  • 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
  • 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;
  • 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等。

技术特点

  • 利用多种分子标签,可以在一个测序文库中同时检测大量样品;

  • 富集转录本5 ‘端测序,避免了3’端测序造成的困难,基因检出率高;

  • 可以与任意标准文库同时上机,因此对测序量要求非常灵活;

  • 非常适用于大规模的差异表达分析。

结果展示

GC含量分布

GC含量分布


Veen图

Veen图


GO注释

GO注释


KEGG代谢通路分类统计

KEGG代谢通路分类统计

样本类型

  • 组织、细胞、体液、总RNA;

样本要求

  • 细胞:2×106 ;
  • 组织:﹥50 mg;
  • 体液:全血、血清、血浆2-3 ml;脑脊液:5 ml;尿液:50 ml;
  • 总RNA:﹥2 μg(至少500ng)

应用案例

MOTS-c and exercise restore cardiac function by activating of NRG1-ErbB signaling in diabetic rats(Frontiers in Endocrinology,5.555)

MOTS-c和有氧运动通过激活NRG1-ErbB信号通路恢复糖尿病大鼠心脏功能

有氧运动和MOTS-c治疗均可显著减少糖尿病心脏结构和功能的异常;有氧运动和MOTS-c所改变的两组糖尿病致病基因其功能均富集于炎症、心肌细胞凋亡、血管生成和内皮细胞增殖三方面,其中NRG1-ErbB4通路可能是MOTS-c在恢复糖尿病心脏功能障碍方面的运动模拟效应的关键。本文的研究可能有助于更好地理解MOTS-c和有氧运动对糖尿病心脏舒张功能障碍的影响,并为MOTS-c改善糖尿病心脏舒张功能障碍的运动模拟分子机制打开了新的思路。

转录组数据差异基因分析结果

转录组数据差异基因分析结果


差异基因的功能富集分析

差异基因的功能富集分析

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