应用方向

1）miRNA表达调控研究： miRNA-Seq可以用于分析不同细胞类型、发育阶段、生理状态或疾病状态下miRNA的表达变化，帮助了解miRNA在基因调控中的作用。

2）miRNA与疾病关联研究： 通过比较疾病患者和正常对照组的miRNA表达数据，可以鉴定与疾病相关的miRNA，从而深入了解miRNA在疾病发生机制中的作用。

3）miRNA与细胞周期、凋亡和分化研究： miRNA-Seq可以帮助了解miRNA在细胞周期、凋亡和分化等生物学过程中的功能。

4）miRNA与癌症研究： miRNA在多种癌症中表达异常，miRNA-Seq可以揭示癌症中miRNA的表达变化，从而了解miRNA在癌症发展中的作用。

5）miRNA与药物治疗研究： 了解miRNA在疾病中的作用有助于研发针对miRNA的治疗策略，如使用miRNA作为治疗靶点或调控剂。

6）miRNA调控网络分析： 通过miRNA-Seq数据，可以构建miRNA与靶基因之间的调控网络，深入了解miRNA的调控机制和作用。

7）miRNA与免疫系统研究： miRNA在调节免疫应答、炎症和免疫细胞分化中发挥重要作用，miRNA-Seq有助于研究miRNA在免疫系统中的功能。

8）miRNA作为生物标志物的应用： 一些miRNA在特定疾病状态下表达明显变化，可以作为潜在的生物标志物，用于疾病的诊断和监测。

应用案例

A fecal miRNA signature by small RNA sequencing accurately distinguishes colorectal cancers: results from a multicentric study（Gastroenterology，2023，IF=33.883）

通过小RNA测序的粪便miRNA标记准确区分结直肠癌:来自多中心研究的结果

目前用于结直肠癌(CRC)筛查的粪便检测在检测早期肿瘤或癌前病变方面的准确性有限。在这方面，作者全面评估了粪便microRNA (miRNA)谱作为非侵入性结直肠癌诊断的生物标志物。在多个生物标本中共进行了1273次小RNA测序实验。在一项横断面研究中，对来自意大利和捷克队列的粪便样本(155例结直肠癌，87例腺瘤，96例其他肠道疾病，141例结肠镜阴性对照)的miRNA谱进行了研究。25个miRNA在CRC患者的粪便中显示改变的水平，包括miR-149-3p、miR-607-5p、miR-1246、miR4488和miR-6777-5p在内的五种miRNA特征将患者与对照组区分开来，并在独立队列中得到验证。该特征将对照组从低/高分期肿瘤和晚期腺瘤中区分出来(AUC=0.82, 95% CI=0.71-0.97)。组织miRNA谱反映了粪便样本的miRNA谱，而不同胃肠道疾病的粪便谱突出了CRC中特异性失调的miRNA。FIT剩余样品中的miRNA谱与保存缓冲液中收集的粪便的miRNA谱具有良好的相关性，并且在腺瘤或CRC患者中可以检测到它们的改变。