产品概述
DNA甲基化（DNA Methylation）是指在甲基转移酶的催化下，S-腺苷甲硫氨酸（SAM）上的甲基添加到DNA分子的碱基上的过程。胞嘧啶第5位碳原子和甲基的共价结合是常见的甲基化形式，胞嘧啶被修饰为5甲基胞嘧啶（5mC）。 目前，全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）主要是通过重亚硫酸盐（Bisulfite）将基因组中未发生甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，然后结合Illumina高通量测序平台，对全基因组范围内胞嘧啶的甲基化水平进行测定，精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态，从而构建全基因组甲基化图谱，进而探究胞嘧啶的甲基化在人类疾病、细胞生长发育过程中的重要机制。
本公司优势
1.建库质量高，失败率低，富有各种类型样本文库构建经验。
2.质控过程全程可溯，实时跟踪，反馈及时，确保数据真实可靠。
3.基础分析丰富，展示形式可个性化定制。
4.个性分析服务：专业的生物信息分析团队，熟悉各种分析算法和软件；根据客户的需求，提供多种个性化的实现方案。
技术原理
应用方向
WGBS广泛用于各种物种，要求全基因组扫描（不错过关键位点）
全基因组甲基化图谱课题
标志物筛选课题
小规模研究课题
技术优势
应用范围广：适用于人和大多数动植物研究（参考基因组已知）
全基因组覆盖：较大限度地获取完整的全基因组甲基化信息，精确绘制甲基化图谱
单碱基分辨率：可精确分析每一个C碱基的甲基化状态
样本类型
DNA、血液、血浆/血清、唾液、组织、细胞、FFPE
送样要求
| 样本类型 | 送样要求 |
|---|---|
| 冰冻新鲜组织 | 新鲜组织≥5mg，立即在液氮中冷冻半小时。-80°C保存，干冰运输。 |
| FFPE组织 | 3~5张FFPE切片，4~5um，0.6mm3。请提供H&E染片。FFPE切片常温运输。 |
| 细胞 | 细胞量≥5×105 ，收集好的细胞离心后，PBS缓冲液洗两遍，立即在液氮中冷冻半小时。-80°C保存，干冰运输。 |
| 血液 | 总量≥0.5ml，抗凝管：柠檬酸钠管或EDTA管，不建议肝素抗凝管。-80°C保存，干冰运输。 |
| 血浆/血清 | 血浆/血清总量≥2.5ml，抗凝管：柠檬酸钠管或EDTA管，不建议肝素抗凝管。-80°C保存，干冰运输。 血液总量≥7.5ml，抗凝管：柠檬酸钠管或EDTA管，不建议肝素抗凝管。-80°C保存，干冰运输。 |
| 唾液 | 1-2ml |
| gDNA | DNA溶于TE buffer，总量≥300ng，浓度20-100ng/ul，体积≥10μL。 |
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Whole-Genome Bisulfite Sequencing of Two Distinct Interconvertible DNA Methylomes of Mouse Embryonic Stem Cells. 两种状态的小鼠胚胎干细胞的甲基化组学研究
背景
小鼠胚胎干细胞一般生长在含有血清的基质中，被称作血清干细胞(serum ESCs)；加两种激酶抑制因子使胚胎干细胞在无血清的情况下更能保持多能性的基态，这种干细胞称为2i干细胞(2i ESCs)；这两种状态的胚胎干细胞可以互相转化。以前这方面的甲基化研究大多基于质谱，覆盖度和研究结果有限，尚缺乏2i胚胎干细胞的甲基化组学研究。
方法
利用全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS），对这两种可互相转换的小鼠胚胎干细胞进行甲基化组学研究
结论
全面的准确的检测了两种小鼠胚胎干细胞的DNA甲基化修饰并进行了系统的比较；同serum ESCs相比，雄性2iESCs全局低甲基化；在血清中，雌性ESCs跟雄性2i ESCs类似呈现全局低甲基化，而在2i ESCs状态下，甲基化水平会进一步降低。
不同状态下小鼠胚胎干细胞的甲基化修饰比较
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