产品概述
环状RNA（circRNA）是一类特殊的非编码RNA分子，也是RNA领域最新的研究热点。与传统的线性RNA（linear RNA，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。近几年的研究表明，circRNA在生物的生长发育、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。CircRNA功能众多，可作为miRNA的海绵，竞争性结合miRNA，发挥ceRNA的调控功能，调控基因表达。近年来还发现与疾病的发生和发展密切相关，在疾病诊断标记物等方向具有很大的应用前景。
本公司优势
多种标准化和个性化分析
标准数据分析：与参考基因组对比、circRNA来源基因分析、预测circRNA、circRNA表达水平分析
技术路线
高级数据分析：circRNA-miRNA互作分析、互作网络图绘制、ceRNA分析、WGCNA分析
circos分析
对CircRNA在基因组上的分布作统计分析，并用circos图呈现出各个样品CircRNA表达量。circos图清晰展示出不同样品某位点环状RNA剪接稳点的数量及junction reads覆盖深度。
差异CircRNA来源基因注释
生物体内，在特定条件下某些基因对应的转录本会形成环状RNA，失去编码功能，从而影响生物学表型。因此，针对circRNA的来源基因分别进行GO和KEGG注释及富集分析，有助于深入挖掘circRNA功能。
CircRNA预测
对环状RNA成环的剪接位点进行预测，候选CircRNA的剪接位点两侧存在GU/AG。相同染色体上来源基因起止位点相同即为同一CircRNA。多个样品取并集得到的所有CircRNA用于后续分析。并且将CircAtlas数据库作为ircBase数据库的补充，使常见物种的已知circRNA鉴定的结果更加完善，更加丰富。
差异CircRNA聚类分析
聚类分析用于判断差异基因在不同实验条件下的表达模式，可通过将表达模式相同或相近的基因聚集成类，从而识别未知基因的功能或已知基因的未知功能，同类基因可能具有相似的功能或共同参与同一代谢过程。对筛选出的差异表达CircRNA做层次聚类分析，将具有相同或相似表达行为的CircRNA进行聚类。
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交互性基因深度挖掘,最新的多组学联合分析方案